Sulautettujen järjestelmien pääaine on jaettu kolmeen ryhmään: sulautetut järjestelmät, digitaalinen signaalinkäsittely sekä säätö- ja automaatiotekniikka. Sulautetuissa järjestelmissä älykkäät laskenta-algoritmit, signaalinkäsittely ja tiedonsiirto ovat keskeisessä roolissa. Korkean tason ohjelmointi- ja kuvauskielten sekä käyttöjärjestelmien osaaminen on keskeisessä asemassa elektroniikkalaitteiden suunnittelussa. Sulautettujen järjestelmien pääaineesta valmistuneet diplomi-insinöörit kykenevät tehokkaasti käyttämään näitä työkaluja sulautetuissa järjestelmissä ja hyödyntämään esimerkiksi signaalinkäsittelyn ja säätötekniikan algoritmeja sovelluksissaan. Pääaineen keskeisiä osa-alueita ovat digitaalielektroniikka, laiteläheinen ohjelmointi, digitaalinen säätö sekä signaalinkäsittely. Sulautettujen järjestelmien opinnot mahdollistavat monipuolisen sijoittumisen teollisuuselektroniikkaja tietoliikennealan eri suunnittelu-, tutkimus- ja tuotekehitystehtäviin. Kokonaisuutta tukevat hyvin sivuainepaketit joltain soveltavan tekniikan osa-alueelta.
Automaatiojärjestelmät perustuvat yhä joustavampaan hajautettuun älyyn. Teollisuuselektroniikkaa ja automaatiotuotteita kehittävät yritykset panostavat voimakkaasti uusiin älykkäisiin tekniikoihin. Pääaineen lukija voi yhdistää automaatiotekniikan ja säätötekniikan alaan kuuluvia opintojaksoja, mikä antaa erinomaiset valmiudet esimerkiksi prosessien ohjaukseen ja säätöön. Teollisuuden eri tason tieto- ja automaatiojärjestelmät integroituvat avoimien tietoliikenne-protokollien ja ohjelmistorajapintojen avulla yhä laajemmiksi kokonaisuuksiksi. Yhdistämällä automaatiotekniikan opiskelun sekä tietoteknisten ja tietoliikenneaineiden opiskelun voi alan insinööri hallita edellä mainittuja kokonaisuuksia. Automaatiotekniikan ja mikroprosessoritekniikan sekä sovelletun elektroniikan tiedot mahdollistavat toimimisen automaatiolaitteiden tai automaatiota sisältävien sulautettujen laitteiden asiantuntijana.
Pääaineen vastuuhenkilöt ovat professori Jero Ahola ja professori Tuomo Lindh.