Tutkimuskohteita sovelletun matematiikan puolella ovat teollisten ja ympäristön prosessien mallinnus, sumeiden systeemien tutkimus sekä opetuksen kehittäminen. Fysiikan laboratorion tutkimuskohteet keskittyvät optiseen mittaustekniikkaan ja materiaalifysiikkaan.
Sovelletun matematiikan laboratorion tärkeimpänä yhteistyöprojektina on toimiminen Suomen Akatemian Inversio-ongelmien huippuyksikössä.
Sovelletun matematiikan laboratorio – Tutkimus
Fysiikan laboratorio – Tutkimus
Fysiikan laboratorio tekee tieteellistä yhteistyötä mm. Joensuun yliopiston ja Turun yliopiston fysiikan laitosten kanssa sekä Oulun yliopiston mittalaitelaboratorion kanssa. Ulkomaalaisia yhteistyökumppaneita ovat Tokion yliopiston sovelletun fysiikan laitos (Japani), Pietarin sähkötekninen yliopisto LETI (Venäjä), Swammerdam-instituutti Amsterdamin yliopistolla (Alankomaat), Atomi- ja molekyylifysiikan instituutti Amsterdamissa (Alankomaat), Moldovan sovelletun fysiikan instituutti Chisinaussa (Moldova), Petroskoin valtion yliopisto (Venäjä) ja Pietarin valtion yliopisto (Venäjä).